RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358506.6

PPP1CB-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PPP1CB, Length 4,771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-202ENST00000358506 TRBC2A0A5B9 178 aa16.04■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 ATG9BQ674R7 924 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 GALNT7Q86SF2 657 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 PKP4Q99569 1192 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.04■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 REEP4Q9H6H4 257 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 TRIM39Q9HCM9 518 aa16.04■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 IL7RP16871 459 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 RYKP34925 604 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 POC5Q8NA72 575 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ALDH4A1P30038 563 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 CLDN8P56748 225 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 10
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PPP1CB-202ENST00000358506 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 KCNC2Q96PR1 638 aa16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 PFKLP17858 780 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 RAB30Q15771 203 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.02■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 ATP6AP1Q15904 470 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.02■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 GPX3P22352 226 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.168e-9■■■■■ 34.8
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PPP1CB-202ENST00000358506 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 LSMEM2Q8N112 164 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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PPP1CB-202ENST00000358506 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 SNX7Q9UNH6 387 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-202ENST00000358506 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 IGLON5A6NGN9 336 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 MPZL2O60487 215 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 STX11O75558 287 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 SNAP29O95721 258 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 HLA-FP30511 346 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
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