RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 OR2A25A4D2G3 310 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TXNDC9O14530 226 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 GPC4O75487 556 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CYC1P08574 325 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MSX1P28360 303 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CMPK1P30085 196 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 PTGS2P35354 604 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 HSF1Q00613 529 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 POU6F1Q14863 301 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TMED2Q15363 201 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 EXT1Q16394 746 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 BBS12Q6ZW61 710 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 VRK3Q8IV63 474 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MREGQ8N565 214 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 M1APQ8TC57 530 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 RND1Q92730 232 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CYTH2Q99418 400 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 OLFM1Q99784 485 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 DPH7Q9BTV6 452 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 DRC3Q9H069 523 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FAM107BQ9H098 131 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 ASB1Q9Y576 335 aa11.32□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 A0A0U1RQJ8 604 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 ZNHIT1O43257 154 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 OR1I1O60431 355 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TOXO94900 526 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TPOP07202 933 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CTNNA2P26232 953 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 PSMB5P28074 263 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 AVPR1BP47901 424 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MAPKAPK3Q16644 382 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 IFT20Q8IY31 132 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SLC5A8Q8N695 610 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 NRGNQ92686 78 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 PBKQ96KB5 322 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SPATA13Q96N96 652 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 LRFN1Q9P244 771 aa11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MROH6A6NGR9 719 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 OR51F1A6NGY5 319 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 GABRR3A8MPY1 467 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FOXS1O43638 330 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 NRP2O60462 931 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 PSMA3P25788 255 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 AOAHP28039 575 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FOXN2P32314 431 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 CCNFP41002 786 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 AGTR2P50052 363 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R50P59544 299 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TFF3Q07654 80 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 FAM53BQ14153 422 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 NDUFA9Q16795 377 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 SYT16Q17RD7 645 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 HKDC1Q2TB90 917 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SPC25-201ENST00000282074 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms