RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUBA1AQ71U36 451 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERINC5Q86VE9 423 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP7Q93009 1102 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDH23Q9H251 3354 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 BNIP3LO60238 219 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTS4O75173 837 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 C9P02748 559 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOX3P41225 446 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC15A1P46059 708 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 Q5BKY6 102 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB2Q8N680 514 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPASTQ9UBP0 616 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A0U1RQF3 1178 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLCA1A8K7I4 914 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMA3DO95025 777 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 APOA1P02647 267 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGS4P49798 205 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 BAK1Q16611 211 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFP69Q49AA0 526 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYT12Q8IV01 421 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR151Q8TDV0 419 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 C7orf34Q96L11 122 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 COPS8Q99627 209 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 Q9Y3F1 56 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGHA2P01877 340 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSF2P04141 144 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 COX7A2P14406 83 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNFSF8P32971 234 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGEH1Q9H213 219 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL26Q9NPH9 171 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDELR3O43731 214 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDH7O60245 1069 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACSL4O60488 711 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR47O94967 919 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPN2O95208 641 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGLV3-27P01718 113 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT6AP02538 564 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT6BP04259 564 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 EBLN1P0CF75 366 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT2B10P36537 528 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT6CP48668 564 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNJ10P78508 379 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEK5Q6P3R8 708 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NELL1Q92832 810 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOXJ1Q92949 421 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PITX2Q99697 317 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNFRSF11BO00300 401 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCRL2O00421 344 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMG1P04279 462 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPIAP49247 311 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITGA1P56199 1179 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NKX3-2P78367 333 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF45Q02386 682 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHRNA6Q15825 494 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFA5Q16718 116 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC58Q4VC31 144 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM180BQ6P0A1 224 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ST6GAL2Q96JF0 529 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR2A14Q96R47 310 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRTM2O43300 516 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 WNT3P56703 355 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKCDQ05655 676 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM60Q495X7 471 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBLL1Q75N03 491 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms