RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-213ENST00000492657 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-213ENST00000492657 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.423e-23■□□□□ 9.4
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PRAME-213ENST00000492657 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa12.42□□□□□ -0.42
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PRAME-213ENST00000492657 GJA8P48165 433 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 HLCSP50747 726 aa12.42□□□□□ -0.42
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PRAME-213ENST00000492657 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 NUMA1Q14980 2115 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 TLL1O43897 1013 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 CBFA2T3O75081 653 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 CATP04040 527 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-213ENST00000492657 GBAP04062 536 aa12.41□□□□□ -0.42
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