RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473584.1

SCP2-208, Transcript of sterol carrier protein 2, human

TSL 2

Gene SCP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCP2-208	ENST00000473584	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	AKAP3	O75969	853 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	BAG3	O95817	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PAX1	P15863	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	SERPINB6	P35237	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	MYL7	Q01449	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	HERC3	Q15034	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PFAS	O15067	1338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	FGF17	O60258	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	KRT33A	O76009	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	DFFB	O76075	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	TSHB	P01222	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	HMOX1	P09601	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	LHCGR	P22888	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	MARK3	P27448	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	OR3A1	P47881	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	STXBP2	Q15833	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	SGCB	Q16585	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584		R4GN57	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584		A0A1B0GUV1	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	EPHB6	O15197	1021 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	GLRA3	O75311	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	DDHD2	O94830	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	CRYAA	P02489	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	EDN1	P05305	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	YES1	P07947	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	KRT3	P12035	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	NR1D1	P20393	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ITGA3	P26006	1051 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	CLDN17	P56750	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PPA1	Q15181	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	NDN	Q99608	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	SPX	Q9BT56	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP2-208	ENST00000473584	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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