RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 USP12O75317 370 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PRAMEF12O95522 483 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RBL1P28749 1068 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 KHKP50053 298 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 HACD2Q6Y1H2 254 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 EXD3Q8N9H8 876 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PIGXQ8TBF5 258 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 C16orf58Q96GQ5 468 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 A6NHS1 94 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CRYZL1O95825 349 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LDLRP01130 860 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 IFNGR1P15260 489 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GADD45AP24522 165 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GDF1P27539 372 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GABRA2P47869 451 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC1A6P48664 564 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ACADVLP49748 655 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF33AQ06730 810 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 NAB1Q13506 487 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GRM7Q14831 915 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MSS51Q4VC12 460 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TXNDC8Q6A555 127 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD7Q92527 254 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RNF145Q96MT1 663 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GBA3Q9H227 469 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MEMO1Q9Y316 297 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 KDM3BQ7LBC6 1761 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MICAL3Q7RTP6 2002 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GNB5O14775 395 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ATP6V1G1O75348 118 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RFPL3O75679 317 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PDE5AO76074 875 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 IL2RAP01589 272 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 F2RP25116 425 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PSMB4P28070 264 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 HTR7P34969 479 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CHRNEQ04844 493 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 NATD1Q8N6N6 113 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DPH3Q96FX2 82 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LGR4Q9BXB1 951 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DHRS7Q9Y394 339 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TSPAN6O43657 245 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC37A4O43826 429 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PEX11AO75192 247 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PROSCO94903 275 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TSPAN12O95859 305 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SRFP11831 508 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LHCGRP22888 699 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GLRA2P23416 452 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DNASE1P24855 282 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TEKQ02763 1124 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.775e-7■■■■□ 25
CENPF-201ENST00000366955 OVGP1Q12889 678 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ERV3-1Q14264 604 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FBXL8Q96CD0 374 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 IGSF21Q96ID5 467 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SFXN2Q96NB2 322 aa4.01□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OR52E6Q96RD3 313 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms