RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc10a7Q5PT53 340 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam71bQ5STT6 665 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r3eQ8BRJ4 279 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TtpaQ8BWP5 278 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gtf2a1lQ8R4I4 468 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr806Q8VFI2 313 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Asb18Q8VHA6 467 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Masp2Q91WP0 685 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankrd61Q9CQM6 421 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Osbpl10S4R1M9 766 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plce1Q8K4S1 2282 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 E9Q0B3 247 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bhlhe40O35185 411 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cct8P42932 548 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lhx1P63006 406 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mapk1P63085 358 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sox4Q06831 440 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usp7Q6A4J8 1103 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PapolgQ6PCL9 739 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1037Q7TR84 321 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lin52Q8CD94 116 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc29a4Q8R139 528 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tomm70Q9CZW5 611 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ItpaQ9D892 198 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cldn9Q9Z0S7 217 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm28363A0A087WQW2 129 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm29776A0A286YEC0 699 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col9a3A2ACT7 680 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trgv2A2J008 116 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc28a1E9PXX9 648 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1600015I10RikE9Q745 711 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dsg2O55111 1122 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mid1O70583 680 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Il1rnP25085 178 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zic1P46684 447 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcnj5P48545 419 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SgcgP82348 291 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ebf1Q07802 591 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptx4Q6RUU0 478 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1322Q7TQW3 310 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr309Q7TS01 308 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mettl20Q80ZM3 255 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Clec4gQ8BNX1 294 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pih1d2Q8CHR9 315 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vps37aQ8CHS8 397 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Agfg1Q8K2K6 561 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gstm4Q8R5I6 218 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr437Q8VEV1 310 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Clcc1Q99LI2 539 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cyp4f14Q9EP75 524 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DguokQ9QX60 277 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adam23Q9R1V7 829 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dpp6Q9Z218 804 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r6H3BK29 913 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdcd5P56812 126 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpr149Q3UVY1 732 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb48Q3UW22 87 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdcd4Q61823 469 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tas2r38Q7TQA6 331 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubp1Q811S7 540 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rab36Q8CAM5 267 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rab15Q8K386 212 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r71Q8VIC0 307 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DgkgQ91WG7 788 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rhox9Q9EQM5 227 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm4775F7ANJ3 135 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Obox5G3X9P6 291 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm8011K7N6Y5 207 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcnk1O08581 336 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GsnP13020 780 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbl1Q64701 1063 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdh7Q8BM92 785 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sertm1Q8CD78 107 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 KptnQ8VCX6 430 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Depdc7Q91WS7 511 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk19Q9JHN8 254 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sars2Q9JJL8 518 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 R3hdmlA2A5I3 253 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Socs2O35717 198 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sbk2P0C5K1 362 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Msr1P30204 458 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MtpnP62774 118 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Itga2Q62469 1178 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CslQ80X68 466 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Efemp1Q8BPB5 493 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bdh2Q8JZV9 245 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 OptcQ920A0 328 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.3 ms