RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KdsrQ6GV12 332 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubtd2Q6PGH0 234 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AftphQ80WT5 931 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BroxQ8K2Q7 411 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam161aQ8QZV6 448 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A6H6Q4 206 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ackr2O08707 378 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtgdsO09114 189 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nthl1O35980 300 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ComtO88587 265 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxa9P09631 271 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn22P29352 802 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnab2P62482 367 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps17P63276 135 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hephl1Q3V1H3 1159 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema4cQ64151 834 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ephx4Q6IE26 359 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnih3Q6ZWS4 160 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med26Q7TN02 588 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp10Q7TQH7 713 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr735Q7TRM4 354 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl42Q8BFQ9 493 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rspo2Q8BFU0 243 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo9Q8BK06 437 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd11Q8K485 232 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dapk2Q8VDF3 370 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr854Q8VFF1 315 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmtm8Q9CZR4 173 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrmuQ9DAT5 417 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrilQ9DBY4 809 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snap29Q9ERB0 260 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Katna1Q9WV86 491 aa12.28□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurod4O09105 330 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtssO70370 340 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BgnP28653 369 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gadd45aP48316 165 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ms4a15Q3UPL6 245 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifb1Q61114 474 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr6a1Q64249 495 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q6P2K3 674 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1152Q7TR34 310 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CpmQ80V42 443 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ribc2Q9D4Q1 309 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbp1Q9QY24 411 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psma4Q9R1P0 261 aa12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldoart2A6ZI47 364 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcna10B2RQA1 511 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp563B8JJZ9 448 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r50E9PW61 861 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spin2eJ3QNQ0 234 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6502L7N456 481 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hk2O08528 917 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kpna3O35344 521 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrp2O35375 931 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AldocP05063 363 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esr1P19785 599 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alox12P39655 663 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdi1P50396 447 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc3P59034 257 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl1P61211 181 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SgcdP82347 289 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfdn4Q3UWL8 134 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bhlha9Q5RJB0 231 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf219Q8K2Y0 722 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr352Q8VGJ9 315 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NoboxQ8VIH1 527 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coro6Q920M5 471 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cers2Q924Z4 380 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MpstQ99J99 297 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adad2Q9D5P4 478 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr12Q9JJA4 423 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nectin1Q9JKF6 515 aa12.27□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim17A0A504 109 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Faap100A2ACJ2 879 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skint8A7XV07 398 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pramef20B1ARV6 477 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigfO09101 219 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E2f3O35261 457 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AprtP08030 180 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HmbsP22907 361 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccl5P30882 91 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp11Q02853 492 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnal1Q05A62 190 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf12Q5SPL2 1003 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.2 ms