RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SOX6P35712 828 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RABIFP47224 123 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TAS2R38P59533 333 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GPM6BQ13491 265 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RIPK1Q13546 671 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 STIM1Q13586 685 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GIT2Q14161 759 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PTGISQ16647 500 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 IFI44LQ53G44 452 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TCTE1Q5JU00 501 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ATAD3BQ5T9A4 648 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 C18orf63Q68DL7 685 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 Q6YL49 198 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SHFQ7M4L6 423 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SLC5A8Q8N695 610 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SLC20A1Q8WUM9 679 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PIGBQ92521 554 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TSSK2Q96PF2 358 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PANX3Q96QZ0 392 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OLFM1Q99784 485 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF747Q9BV97 191 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TRPV6Q9H1D0 765 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 P2RY12Q9H244 342 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 KCNN2Q9H2S1 579 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TOR3AQ9H497 397 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CNGB3Q9NQW8 809 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 HOMER3Q9NSC5 361 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CENPMQ9NSP4 180 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TNS2Q63HR2 1409 aa2.14□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM30A4D0T7 59 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 VGLL3A8MV65 326 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 STMND1H3BQB6 276 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD28O15084 1053 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 XRCC3O43542 346 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OR6B1O95007 311 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CCNCP24863 283 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3R1P27986 724 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TKTP29401 623 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 SPIBQ01892 262 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 KLC1Q07866 573 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TUBA3CQ13748 450 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC142Q17RM4 750 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 AKNAD1Q5T1N1 836 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LYSMD4Q5XG99 296 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TUBA3EQ6PEY2 450 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PALB2Q86YC2 1186 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SMPDL3BQ92485 455 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 INSRP06213 1382 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PP11 408 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM129A0AVI4 362 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf51A6NDU8 294 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A18H0YCH9 400 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 UBXN8O00124 270 aa2.13□□□□□ -2.07
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