RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 HSPA12AO43301 675 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EEDO75530 441 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TCEAL1Q15170 157 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ACP6Q9NPH0 428 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ITPKAP23677 461 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MAP2K3P46734 347 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HCAR3P49019 387 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CLCN7P51798 805 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 IKBKEQ14164 716 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GNMTQ14749 295 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PGAP1Q75T13 922 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ANKFN1Q8N957 763 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 AVL9Q8NBF6 648 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HSH2DQ96JZ2 352 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CD180Q99467 661 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EPYCQ99645 322 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EQTNQ9NQ60 294 aa16.51■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HLCSP50747 726 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SP140Q13342 867 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MOGSQ13724 837 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SRRDQ9UH36 339 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C4AP0C0L4 1744 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C4BP0C0L5 1744 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PGAM2P15259 253 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NUDT13Q86X67 352 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NTAN1Q96AB6 310 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ASPNQ9BXN1 380 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 M0R129 80 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CDH11P55287 796 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 VLDLRP98155 873 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CARM1Q86X55 608 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NXPE1Q8N323 547 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF709Q8N972 641 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PKP2Q99959 881 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 S100A10P60903 97 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 RICTORQ6R327 1708 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SOX30O94993 753 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GPR33Q49SQ1 333 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ART5Q96L15 291 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 J3QRK9 145 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TBL1XO60907 577 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 AMHP03971 560 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 VAMP1P23763 118 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PPP5CP53041 499 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FBXL8Q96CD0 374 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 IFNA17P01571 189 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 AKR1A1P14550 325 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NCS1P62166 190 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 LRRC66Q68CR7 880 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 REEP3Q6NUK4 255 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HASPINQ8TF76 798 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 KCNC2Q96PR1 638 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CD6P30203 668 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HOXC12P31275 282 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CD97P48960 835 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.5■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CDKN2CP42773 168 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C2orf74A8MZ97 194 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EBF4Q9BQW3 602 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PIK3C2AO00443 1686 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms