RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SPATS1Q496A3 300 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FKBP10Q96AY3 582 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ART5Q96L15 291 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ISPDA4D126 451 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC35F4A4IF30 521 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MANBAO00462 879 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 OR10H3O60404 316 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NKX3-2P78367 333 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 STARD3Q14849 445 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 OSER1Q9NX31 292 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 STMN3Q9NZ72 180 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 AP3D1O14617 1153 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 IFNA8P32881 189 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PTGER3P43115 390 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NFE2L1Q14494 772 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FZD4Q9ULV1 537 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PADI3Q9ULW8 664 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PIPSLA2A3N6 862 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FABP12A6NFH5 140 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MROH6A6NGR9 719 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PCDHGA12O60330 932 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 OLR1P78380 273 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC35A2P78381 396 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZNF45Q02386 682 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SCN1BQ07699 218 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CHIT1Q13231 466 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CACUL1Q86Y37 369 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TMCO6Q96DC7 493 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MGLLQ99685 303 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ASPNQ9BXN1 380 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 KCNK2O95069 426 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PDYNP01213 254 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ABRQ12979 859 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZNF284Q2VY69 593 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 AGAP6Q5VW22 663 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MFSD4AQ8N468 514 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FLCNQ8NFG4 579 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 AGAP4Q96P64 663 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CFL2Q9Y281 166 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PRSS23O95084 383 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 HTR2BP41595 481 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TUSC3Q13454 348 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SYTL3Q4VX76 610 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZBTB2Q8N680 514 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 VMP1Q96GC9 406 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CD84Q9UIB8 345 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 HSPB11Q9Y547 144 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ARID2Q68CP9 1835 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZNF197O14709 1029 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DNAJB5O75953 348 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PTTG1O95997 202 aa14.85□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 C9P02748 559 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms