RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 NEU1Q99519 415 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 COL20A1Q9P218 1284 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ASPDHA6ND91 283 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD28O15084 1053 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GADD45AP24522 165 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CYP2C18P33260 490 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GALNSP34059 522 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 AVPR1AP37288 418 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SOX9P48436 509 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ERVK-8P63133 956 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PRKG2Q13237 762 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 DGCR6Q14129 220 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC66Q68CR7 880 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SNX20Q7Z614 316 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NTAN1Q96AB6 310 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PHF21AQ96BD5 680 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 COL21A1Q96P44 957 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 H3BM21 787 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 M0R082 166 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PIP5K1BO14986 540 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PER2O15055 1255 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CYP7B1O75881 506 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PFKMP08237 780 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CTSHP09668 335 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.032e-8■■■■□ 25
GPBP1-208ENST00000514387 MAGEA2P43356 314 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NRIP1P48552 1158 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 RAB13P51153 203 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ABRQ12979 859 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MAB21L1Q13394 359 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MAJINQ3KP22 176 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 RAB6CQ53S08 254 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 C11orf88Q6PI97 169 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 RBFAQ8N0V3 343 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CCNYQ8ND76 341 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 REPS1Q96D71 796 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SLC9A7Q96T83 725 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 UCK2Q9BZX2 261 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 XKR8Q9H6D3 395 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FKBP7Q9Y680 259 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PDHXO00330 501 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NOBOXO60393 691 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 COX5BP10606 129 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GOT1P17174 413 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SAT1P21673 171 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FMO4P31512 558 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FMO3P31513 532 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CA5AP35218 305 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 LIPAP38571 399 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KCNJ5P48544 419 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TPMTP51580 245 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FOXO1Q12778 655 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GALEQ14376 348 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CSHL1Q14406 222 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ELP2Q6IA86 826 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CERS5Q8N5B7 392 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 RNF139Q8WU17 664 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GPR137Q96N19 417 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ACSS2Q9NR19 701 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GDE1Q9NZC3 331 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms