RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 EVPLQ92817 2033 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC189A1A4V9 331 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 GAGE12JA6NER3 117 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 H0Y626 953 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 PLK4O00444 970 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CAPN9O14815 690 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMA7O14818 248 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MAPK13O15264 365 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 KLK10O43240 276 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TIMM44O43615 452 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ACSL4O60488 711 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TMCC1O94876 653 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SEMA4FO95754 770 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 VDRP11473 427 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 OXTRP30559 389 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CCKBRP32239 447 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 MATKP42679 507 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 ST8SIA6P61647 398 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CETN1Q12798 172 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CDH18Q13634 790 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ACCSLQ4AC99 568 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM215Q68D42 235 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PMF1Q6P1K2 205 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 SLC35C1Q96A29 364 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 UBXN6Q9BZV1 441 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ACP6Q9NPH0 428 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF580Q9UK33 172 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-211ENST00000492895 LRRK2Q5S007 2527 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 OR6C68A6NDL8 312 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PEX12O00623 359 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MID1O15344 667 aa3.2□□□□□ -1.9
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