RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	TOR3A	Q9H497	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ASB6	Q9NWX5	421 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	RNF150	Q9ULK6	438 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	COL4A3	Q01955	1670 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FAM149A	A5PLN7	773 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452		A6NNC1	897 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	PLK4	O00444	970 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	RASGRF2	O14827	1237 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ANKRD28	O15084	1053 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CTDSPL	O15194	276 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	OR10H2	O60403	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	RAD51D	O75771	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SBK2	P0C263	348 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	GHR	P10912	638 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	LBP	P18428	481 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SERPINB6	P35237	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	HSD17B3	P37058	310 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ASMT	P46597	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	IER3	P46695	156 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	NPBWR1	P48145	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	MFAP3	P55082	362 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	UCP2	P55851	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SLC26A5	P58743	744 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FOLH1	Q04609	750 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	PLA2G7	Q13093	441 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FOXE3	Q13461	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	LAMB3	Q13751	1172 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CTF1	Q16619	201 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	DUSP6	Q16828	381 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	NEK5	Q6P3R8	708 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	MON1B	Q7L1V2	547 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	GPR180	Q86V85	440 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	GPSM1	Q86YR5	675 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	VRK3	Q8IV63	474 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SLC5A8	Q8N695	610 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FBXO30	Q8TB52	745 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SLC25A28	Q96A46	364 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CDCA5	Q96FF9	252 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	VPS39	Q96JC1	886 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	PANX3	Q96QZ0	392 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	PKP2	Q99959	881 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	P2RY12	Q9H244	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CDH20	Q9HBT6	801 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	BRCA2	P51587	3418 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	OTOF	Q9HC10	1997 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SNED1	Q8TER0	1413 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ATP8B3	O60423	1300 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452		A0A0G2JK05	382 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452		A0A1W2PPW3	197 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BBS2-215	ENST00000566452	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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