RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 H2AFVQ71UI9 128 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN33Q86UF1 283 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 MYOCDQ8IZQ8 938 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 DSELQ8IZU8 1212 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CNBD1Q8NA66 436 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 STKLD1Q8NE28 680 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FBXO25Q8TCJ0 367 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TEKT4Q8WW24 435 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RND1Q92730 232 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CD101Q93033 1021 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PHF21BQ96EK2 531 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CALML4Q96GE6 196 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 MBOAT7Q96N66 472 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PSMB7Q99436 277 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TSC22D3Q99576 134 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 LRRC19Q9H756 370 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FBXL17Q9UF56 701 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TMCO1Q9UM00 188 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ITGB4P16144 1822 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NFASCO94856 1347 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 LINC01553A4QN01 128 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RASGRF2O14827 1237 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 KCNJ13O60928 360 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN9O75954 239 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GAGE7O76087 117 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RB1P06400 928 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GAGE12FP0CL80 117 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GAGE12GP0CL81 117 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GAGE12IP0CL82 117 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TAC1P20366 129 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ITGB8P26012 769 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 IVDP26440 423 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PON1P27169 355 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ACADLP28330 430 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PTPN4P29074 926 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GNA11P29992 359 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CAMPP49913 170 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R40P59535 323 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 DR1Q01658 176 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CAV1Q03135 178 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 EGR4Q05215 589 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GRIK2Q13002 908 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 COASYQ13057 564 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GAGE1Q13065 139 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GAGE4Q13068 117 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CUL3Q13618 768 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RAB41Q5JT25 222 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 KIF6Q6ZMV9 814 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PEX26Q7Z412 305 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FJX1Q86VR8 437 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 HACE1Q8IYU2 909 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NME8Q8N427 588 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PRELID2Q8N945 189 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 KIFAP3Q92845 792 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 KXD1Q9BQD3 176 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 VCXQ9H320 206 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 AZI2Q9H6S1 392 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ZWILCHQ9H900 591 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NOX4Q9NPH5 578 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms