RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 KRT86O43790 486 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 MATN4O95460 622 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 C1orf105O95561 183 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 FGGP02679 453 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ESR1P03372 595 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 RPN2P04844 631 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 APOA4P06727 396 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 MGAT1P26572 445 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PSMB5P28074 263 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 FOLR3P41439 243 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GRIA3P42263 894 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CLCN7P51798 805 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 EFNA3P52797 238 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 RRADP55042 308 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PRAMEP78395 509 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CDK16Q00536 496 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 HSPA14Q0VDF9 509 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 SNX1Q13596 522 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 MYBPC3Q14896 1274 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 BRD3Q15059 726 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 TMED2Q15363 201 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 RPS6KA1Q15418 735 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CYP1B1Q16678 543 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 C1orf189Q5VU69 101 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 C4orf22Q6V702 233 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 Q6ZS92 163 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CENPUQ71F23 418 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GPR135Q8IZ08 494 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 TEX19Q8NA77 164 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 OR2L3Q8NG85 312 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 MFSD3Q96ES6 412 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 IP6K3Q96PC2 410 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ACSS2Q9NR19 701 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GPR83Q9NYM4 423 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 C5AR2Q9P296 337 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CTSFQ9UBX1 484 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 SOX13Q9UN79 622 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 NFS1Q9Y697 457 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ESPL1Q14674 2120 aa4.15□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 ISM1B1AKI9 464 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 TARM1B6A8C7 271 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 E7EVH7 732 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 F8W8V4 182 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 H3BMM5 538 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 AGPSO00116 658 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 MASP2O00187 686 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 AP3B1O00203 1094 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 KDM1AO60341 852 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 DPM1O60762 260 aa4.14□□□□□ -1.75
PHF20-212ENST00000485604 PHF2O75151 1096 aa4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms