RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THAP1Q9NVV9 213 aa9.28□□□□□ -0.92
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF358Q9NW07 568 aa9.28□□□□□ -0.92
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC189A1A4V9 331 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.27□□□□□ -0.93
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.27□□□□□ -0.93
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 MDFIQ99750 246 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P2RY12Q9H244 342 aa9.27□□□□□ -0.93
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 OXSMQ9NWU1 459 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED16Q9Y2X0 877 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.26□□□□□ -0.93
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM114B3SHH9 223 aa9.26□□□□□ -0.93
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 UGT2B4P06133 528 aa9.26□□□□□ -0.93
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRSS56P0CW18 603 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THRAP10827 490 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYL2P10916 166 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RALBP11234 206 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEFHP12036 1026 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF30P17039 623 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BPIP17213 487 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFKBIAP25963 317 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSF2RBP32927 897 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPAM1P38567 509 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGA1P56199 1179 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJB13P59910 316 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MC2RQ01718 297 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASPHQ12797 758 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFT88Q13099 833 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF460Q14592 562 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLC3Q6P597 504 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX20Q7Z614 316 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDH24Q86UP0 819 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ESX1Q8N693 406 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC126Q96EE4 140 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDXPQ96GD0 296 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.26□□□□□ -0.93
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