RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q6P1I3 445 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Serpina12Q7TMF5 413 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmtc4Q8BG19 741 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Strip2Q8C9H6 844 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Stx19Q8R1Q0 292 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gps2Q921N8 327 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AasdhpptQ9CQF6 309 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Uqcc2Q9CQY6 136 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Bpifa3Q9D9J8 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc22Q9JIG7 627 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TrehQ9JLT2 576 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Actl7bQ9QY83 418 aa15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1700011I03RikE9PYL8 271 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Best1O88870 551 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mcpt1P11034 246 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Srp54P14576 504 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Esr1P19785 599 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 UoxP25688 303 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nanos3P60324 178 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 NrtnP97463 195 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dnajc11Q5U458 559 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf728Q6P5C7 752 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nrde2Q80XC6 1172 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rhox11Q810N8 206 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Eme1Q8BJW7 570 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ClyblQ8R4N0 338 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rpe65Q91ZQ5 533 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4930550L24RikQ99PA7 320 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FopnlQ9CZS3 174 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tor1bQ9ER41 336 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Plscr1Q9JJ00 328 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rgs20Q9QZB1 239 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dock6Q8VDR9 2080 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Plxnd1Q3UH93 1925 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm28360A0A087WR25 190 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm14862B1AV28 81 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sec14l5B2RXM5 696 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm3542K7N6U2 270 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hcn4O70507 1186 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mtnd3P03899 115 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gal3st3P61315 431 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ypel5P62700 121 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q32M26 199 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ube2zQ3UE37 356 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pou4f2Q63934 411 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cpsf6Q6NVF9 551 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sec24dQ6NXL1 1032 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ptx4Q6RUU0 478 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Smg5Q6ZPY2 1017 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Clec4b1Q7TS58 209 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gstm7Q80W21 218 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q8BHB7 409 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mblac2Q8BL86 279 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PstkQ8BP74 359 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Med25Q8VCB2 745 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 EdaraddQ8VHX2 208 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 NlnQ91YP2 704 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pdia5Q921X9 517 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 EbplQ9D0P0 206 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Wdr5bQ9D7H2 328 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TcimQ9D915 106 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Entpd5Q9WUZ9 427 aa15□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CntrlA2AL36 2334 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm3173A6NAS3 172 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Arl9F7BE40 171 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FpgtG5E8F4 590 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Spdye4cI6XKQ3 339 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kcnk1O08581 336 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gstm6O35660 218 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FurinP23188 793 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CatP24270 527 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rab21P35282 222 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CratP47934 626 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 BckdhaP50136 442 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Calb2Q08331 271 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q3USZ8 430 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Xkr9Q5GH62 373 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrif1Q8CDD9 755 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pih1d2Q8CHR9 315 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Clip4Q8CI96 704 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ankrd49Q8VE42 238 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr701Q9D3U9 316 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TesclQ9DAJ7 231 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Poc5Q9DBS8 558 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr630Q9EQQ7 319 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Spag4Q9JJF2 443 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa14.99□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4931406B18RikA2RSL7 367 aa14.98□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Proca1B0QZF7 307 aa14.98□□□□□ -0.01
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm15155B1B034 138 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.5 ms