Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CratP47934 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CratP47934 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CratP47934 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CratP47934 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CratP47934 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CratP47934 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CratP47934 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CratP47934 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CratP47934 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CratP47934 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CratP47934 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CratP47934 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CratP47934 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CratP47934 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CratP47934 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CratP47934 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CratP47934 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CratP47934 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CratP47934 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CratP47934 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CratP47934 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CratP47934 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CratP47934 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CratP47934 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CratP47934 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CratP47934 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CratP47934 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CratP47934 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CratP47934 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CratP47934 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CratP47934 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CratP47934 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CratP47934 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CratP47934 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CratP47934 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CratP47934 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CratP47934 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CratP47934 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CratP47934 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CratP47934 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CratP47934 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CratP47934 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CratP47934 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CratP47934 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CratP47934 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CratP47934 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CratP47934 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CratP47934 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CratP47934 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CratP47934 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CratP47934 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CratP47934 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CratP47934 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CratP47934 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CratP47934 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CratP47934 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CratP47934 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CratP47934 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CratP47934 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CratP47934 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CratP47934 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CratP47934 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CratP47934 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CratP47934 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CratP47934 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CratP47934 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CratP47934 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CratP47934 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CratP47934 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CratP47934 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CratP47934 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CratP47934 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CratP47934 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CratP47934 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CratP47934 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CratP47934 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CratP47934 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CratP47934 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CratP47934 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CratP47934 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CratP47934 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CratP47934 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CratP47934 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CratP47934 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CratP47934 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CratP47934 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CratP47934 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CratP47934 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CratP47934 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CratP47934 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CratP47934 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CratP47934 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CratP47934 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CratP47934 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CratP47934 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CratP47934 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CratP47934 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CratP47934 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CratP47934 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms