RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 PAX1P15863 534 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 LBPP18428 481 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 KRT2P35908 639 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 MNDAP41218 407 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 NR2C2P49116 596 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PDX1P52945 283 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CLDN15P56746 228 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PTENP60484 403 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ROR1Q01973 937 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PRKCZQ05513 592 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 HERC3Q15034 1050 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 SUSD4Q5VX71 490 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 DET1Q7L5Y6 550 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 KRT77Q7Z794 578 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 APCDD1Q8J025 514 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 EID3Q8N140 333 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TM9SF4Q92544 642 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ZNF653Q96CK0 615 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 MGME1Q9BQP7 344 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 GKN1Q9NS71 199 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TBC1D7Q9P0N9 293 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 DNAJB9Q9UBS3 223 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 POLLQ9UGP5 575 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 NME7Q9Y5B8 376 aa2.96□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PRQ8 180 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CLDN4O14493 209 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ATP6AP2O75787 350 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 FAM58BPP0C7Q3 252 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PATE4P0C8F1 98 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ALDH1B1P30837 517 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 HOXC8P31273 242 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 GP5P40197 560 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TERF1P54274 439 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TFCP2Q12800 502 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CUL3Q13618 768 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ISCA2Q86U28 154 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CDK20Q8IZL9 346 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 NKAIN3Q8N8D7 197 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 IQUBQ8NA54 791 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TRIM58Q8NG06 486 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 OR4C3Q8NH37 302 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 NSMAFQ92636 917 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PRAC1Q96KF2 57 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 EDEM3Q9BZQ6 932 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CDH20Q9HBT6 801 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 COQ3Q9NZJ6 369 aa2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 FAM172BPA6NC97 362 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ENO4A6NNW6 628 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 FPGTO14772 594 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PIGNO95427 931 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 BAG3O95817 575 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 AMBPP02760 352 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 GBAP04062 536 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 GPIP06744 558 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CFC1BP0CG36 223 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CFC1P0CG37 223 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PDGFRAP16234 1089 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 EPCAMP16422 314 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 SLC6A6P31641 620 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 MAP2K2P36507 400 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ASCL1P50553 236 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PHEXP78562 749 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 PSMD6Q15008 389 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 TAZQ16635 292 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ALDH1L2Q3SY69 923 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ACCSLQ4AC99 568 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 C6orf136Q5SQH8 315 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 ZNF449Q6P9G9 518 aa2.94□□□□□ -1.94
SENP6-208ENST00000483859 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms