RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 GNB1P62873 340 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SP3Q02447 781 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CUL3Q13618 768 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SQLEQ14534 574 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 XKR3Q5GH77 459 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TCTE1Q5JU00 501 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 MMD2Q8IY49 270 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 OR4C3Q8NH37 302 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PIGBQ92521 554 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 NR4A3Q92570 626 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SPSB1Q96BD6 273 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 GIMAP5Q96F15 307 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 H7C0S8 307 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 AP5Z1O43299 807 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ZG16O60844 167 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 DDHD2O94830 711 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PENKP01210 267 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CA6P23280 308 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 MT3P25713 68 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 WNT5AP41221 380 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LIMK1P53667 647 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ZNF790Q6PG37 636 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CCDC186Q7Z3E2 898 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TLK2Q86UE8 772 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PIGZQ86VD9 579 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LGI2Q8N0V4 545 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 BMPERQ8N8U9 685 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 OR52N5Q8NH56 324 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LGALS12Q96DT0 336 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LITAFQ99732 161 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CDH20Q9HBT6 801 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 STUB1Q9UNE7 303 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TNNQ9UQP3 1299 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TRIM17Q9Y577 477 aa3.81□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PPK0 400 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 C2orf81A6NN90 581 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ARPC2O15144 300 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 EML2O95834 649 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CSN3P07498 182 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 HMBSP08397 361 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 FAM157CP0CG43 387 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CEACAM1P13688 526 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 IRF2P14316 349 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 UBASH3AP57075 661 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 GCNT1Q02742 428 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 MZT1Q08AG7 82 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 ITGA7Q13683 1181 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 HERC3Q15034 1050 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LCE1EQ5T753 118 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 OR2T11Q8NH01 316 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 KIF18AQ8NI77 898 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 PRAC1Q96KF2 57 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LRR1Q96L50 414 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LRRC3BQ96PB8 259 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.8□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 KRT86O43790 486 aa3.79□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 DFFBO76075 338 aa3.79□□□□□ -1.8
RBM39-211ENST00000426951 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms