RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 JUPP14923 745 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HALP42357 657 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 DMPKQ09013 629 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHIT1Q13231 466 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 IMPG1Q17R60 797 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 AP5B1Q2VPB7 878 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 REP15Q6BDI9 236 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM69Q86WT6 500 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 DENND6BQ8NEG7 585 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELOVL6Q9H5J4 265 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPRC5BQ9NZH0 403 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACSL5Q9ULC5 683 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUMA1Q14980 2115 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPN2P04844 631 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP2CBP62714 309 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP2CAP67775 309 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 IRF8Q02556 426 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF33BQ06732 778 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF480Q8WV37 535 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRCH3Q96II8 777 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HBEGFQ99075 208 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMM29Q9BSF4 260 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR41Q9HAD4 459 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERTM1A2A2V5 107 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLGNO14967 610 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMNAP02545 664 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRG2P18507 467 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD72P21854 359 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCND1P24385 295 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPMTP51580 245 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HACD2Q6Y1H2 254 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXW8Q8N3Y1 598 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2T34Q8NGX1 318 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SELENOMQ8WWX9 145 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAD51AP1Q96B01 352 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf50Q9BV19 199 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTBD1Q9H0C5 482 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASF1AQ9Y294 204 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFAF1Q9Y375 327 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC72A6NJI9 287 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBP2O00757 339 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC31A1O15431 190 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNPDA1P46926 289 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NME5P56597 212 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRP8Q14114 963 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR60Q8WVS4 1066 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGK2Q9HBY8 427 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRASO14807 208 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 KELP23276 732 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTTPP55157 894 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGO1Q5FBB7 561 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 COQ5Q5HYK3 327 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF852Q6ZMS4 543 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYTL1Q8IYJ3 562 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TM7SF3Q9NS93 570 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNE2Q9Y6J6 123 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NR5A2O00482 541 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ENTPD5O75356 428 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A3O75751 556 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDYNP01213 254 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEACAM5P06731 702 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC2A4P14672 509 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNF4AP41235 474 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 XKR6Q5GH73 641 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf146Q5VVC0 180 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGL4Q8IZJ4 473 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPFIBP2Q8ND30 876 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ROPN1LQ96C74 230 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 FZD3Q9NPG1 666 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 CIDEBQ9UHD4 219 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAMEF4O60810 478 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNAZP19086 355 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNK10P57789 538 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1024LP59773 190 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL23RQ5VWK5 629 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNT13Q8IUC8 556 aa28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms