RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	LCN10	Q6JVE6	187 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	KCNMB4	Q86W47	210 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	RNF14	Q9UBS8	474 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PADI1	Q9ULC6	663 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SEC16A	O15027	2179 aa		20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ISM1	B1AKI9	464 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	GABRB3	P28472	473 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PAFAH1B1	P43034	410 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CDC20	Q12834	499 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ZNF843	Q8N446	348 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		20.13	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996		E5RI56	91 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	KDM1A	O60341	852 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	MT-ND3	P03897	115 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FAM87A	P0C7U9	286 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	RORA	P35398	523 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ELK3	P41970	407 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	DNASE1L3	Q13609	305 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CUL1	Q13616	776 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CALML6	Q8TD86	181 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	KCNJ9	Q92806	393 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TCTN2	Q96GX1	697 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	GPR21	Q99679	349 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FANCE	Q9HB96	536 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		20.12	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TTC4	O95801	387 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FURIN	P09958	794 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TCN2	P20062	427 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	MAG	P20916	626 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PSMB5	P28074	263 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PDIK1L	Q8N165	341 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CD200R1	Q8TD46	325 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CFAP36	Q96G28	342 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SNF8	Q96H20	258 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		20.11	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PPV9	198 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	KATNA1	O75449	491 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CYP2A7	P20853	494 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CCNF	P41002	786 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ITGA1	P56199	1179 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	HIF1A	Q16665	826 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	STEAP4	Q687X5	459 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FCRL6	Q6DN72	434 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	C16orf46	Q6P387	395 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	MR1	Q95460	341 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	MED8	Q96G25	268 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	FOPNL	Q96NB1	174 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	LRFN5	Q96NI6	719 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	NDN	Q99608	321 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	NAT9	Q9BTE0	207 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	CHST8	Q9H2A9	424 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	SNX24	Q9Y343	169 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	DHRS7	Q9Y394	339 aa		20.1	■□□□□ 0.81
CS-222	ENST00000550996	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		20.09	■□□□□ 0.81

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