RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKAA1Q13131 559 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBB3Q13509 450 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 KCNJ11Q14654 390 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNAB1Q14722 419 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 BRD3Q15059 726 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP1B1Q16678 543 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 SYTL3Q4VX76 610 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 ARMC3Q5W041 872 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC35F6Q8N357 371 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 PHC3Q8NDX5 983 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 HGH1Q9BTY7 390 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 POLG2Q9UHN1 485 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 POMT2Q9UKY4 750 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 RARRES3Q9UL19 164 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 ASF1AQ9Y294 204 aa6.22□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.22□□□□□ -1.41
CTDSPL-208ENST00000486978 COL6A5A8TX70 2615 aa6.21□□□□□ -1.41
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CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 C2orf74A8MZ97 194 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 BTN3A3O00478 584 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 BTN3A1O00481 513 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CES2O00748 559 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 CDH3P22223 829 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ARNTP27540 789 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 NMBRP28336 390 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 SHMT2P34897 504 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS41P49754 854 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PGDP52209 483 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 TUBB2AQ13885 445 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 OR8K5Q8NH50 307 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KIFC1Q9BW19 673 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 NUDT9Q9BW91 350 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CARD6Q9BX69 1037 aa6.21□□□□□ -1.42
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