RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-10P10266 1014 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 TCN2P20062 427 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CLCN7P51798 805 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ZIC1Q15915 447 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CCSMST1Q4G0I0 132 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 FAM60AQ9NP50 221 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.13■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 TERTO14746 1132 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MATN4O95460 622 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ELK3P41970 407 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ITGA1P56199 1179 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CDC20Q12834 499 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 DNASE1L3Q13609 305 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 HIF1AQ16665 826 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf46Q6P387 395 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 FAM20CQ8IXL6 584 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 KCNJ9Q92806 393 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MR1Q95460 341 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CLIP3Q96DZ5 547 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CATSPER2Q96P56 530 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.12■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 KRT87PA6NCN2 255 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ARL4CP56559 192 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 GPS2Q13227 327 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 GPR135Q8IZ08 494 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MED8Q96G25 268 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP36Q96G28 342 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SLC30A3Q99726 388 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA4CQ9C0C4 833 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL42Q9P2K6 505 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL20Q9Y2M5 609 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MED16Q9Y2X0 877 aa23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 C21orf140B9A014 251 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 E7EQ34 232 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MAGP20916 626 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CUL1Q13616 776 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SF1Q15637 639 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 BORAQ6PGQ7 559 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 EXD3Q8N9H8 876 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 INPP5DQ92835 1189 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC39Q96DD0 335 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CERS2Q96G23 380 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 LRFN5Q96NI6 719 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 GPR21Q99679 349 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SNX24Q9Y343 169 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 DHRS7Q9Y394 339 aa23.1■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP46Q8IYW2 2715 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF33A8MVX0 844 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 MEN1O00255 615 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 VPS26AO75436 327 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 C1QL1O75973 258 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 OR2B3O76000 313 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CATP04040 527 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 FAM87AP0C7U9 286 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 C19orf57Q0VDD7 668 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA7Q9P0W8 599 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.09■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 NDC80O14777 642 aa23.08■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF749O43361 778 aa23.08■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 HCRTR1O43613 425 aa23.08■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 GABRA4P48169 554 aa23.08■■□□□ 1.29
SMKR1-201ENST00000462322 RPS15P62841 145 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms