RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 M0R129 80 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ACOX3O15254 700 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SGPL1O95470 568 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CSF3P09919 207 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GADD45AP24522 165 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NUDT1P36639 197 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PGDP52209 483 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GAD2Q05329 585 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAAP100Q0VG06 881 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL18Q14116 193 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IRF4Q15306 451 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DHCR24Q15392 516 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC66Q68CR7 880 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LINGO4Q6UY18 593 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR8K5Q8NH50 307 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 POMPQ9Y244 141 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DPPA5A6NC42 116 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GPR25O00155 361 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS3O15072 1205 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BMP2P12643 396 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSD17B1P14061 328 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRKCHP24723 683 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ACOT2P49753 483 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HLCSP50747 726 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPOCK1Q08629 439 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CERS5Q8N5B7 392 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OXSMQ9NWU1 459 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF639Q9UID6 485 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 SPTLC1O15269 473 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEM31Q5JXX7 168 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 CUZD1Q86UP6 607 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF567Q8N184 647 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 TXN2Q99757 166 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC9A4Q6AI14 798 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.82□□□□□ -1.64
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