RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		5.09	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		5.09	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		5.09	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		5.09	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		5.09	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CHD1	P32657	1468 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RGP1	P16664	663 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	UBP1	P25037	809 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SCD5	P34758	872 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YKL069W	P36088	180 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	EXO84	P38261	753 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PKH1	Q03407	766 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	HSP42	Q12329	375 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MLF3	P32047	452 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	VTC2	P43585	828 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PIP2	P52960	996 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YMR187C	Q03236	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RKR1	Q04781	1562 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MET5	P47169	1442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SPT7	P35177	1332 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CAN1	P04817	590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	BAS1	P22035	811 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	ANP1	P32629	500 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YBR184W	P38299	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	APE4	P38821	490 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	GEM1	P39722	662 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MNT3	P40549	630 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MRPS18	P42847	217 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CWH41	P53008	833 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YNL165W	P53891	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YNL034W	P53963	612 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YNL018C	P53976	612 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	UFD2	P54860	961 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	UME1	Q03010	460 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	HEH2	Q03281	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	ESC2	Q06340	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TDA6	Q06466	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	THI73	Q07904	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YOL087C	Q99247	1116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PAN1	P32521	1480 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CDC34	P14682	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	NPR1	P22211	790 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	ARE1	P25628	610 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TFC4	P33339	1025 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PEX5	P35056	612 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RIM4	P38741	713 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	FAA3	P39002	694 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SAP185	P40856	1058 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	COG6	P53959	839 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TGL2	P54857	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MET14	Q02196	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YML131W	Q03102	365 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RPB10	P22139	70 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CHS3	P29465	1165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PXA2	P34230	853 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	YBR071W	P38243	211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RXT2	P38255	430 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	BTN2	P53286	410 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RCF1	Q03713	159 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	VTI1	Q04338	217 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TOS4	Q06266	489 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TRE2	Q08693	809 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	MMS22	Q06164	1454 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	GAL1	P04385	528 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	EUG1	P32474	517 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SUV3	P32580	737 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	ISC10	P32645	267 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	RRN3	P36070	627 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SKN7	P38889	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	TMA108	P40462	946 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	HUL4	P40985	892 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YRA2	YKL214C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6

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