RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	PEX28	P38848	579 aa		3.7	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	YFL054C	P43549	646 aa		3.7	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	GCV2	P49095	1034 aa		3.7	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	VPS62	P53285	467 aa		3.7	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	EMC1	P25574	760 aa		3.69	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	DCG1	P32460	244 aa		3.68	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	SQT1	P35184	431 aa		3.68	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	RFC5	P38251	354 aa		3.68	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	SAM37	P50110	327 aa		3.68	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	ULP1	Q02724	621 aa		3.68	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	PTC5	Q12511	572 aa		3.68	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	YGL140C	P53120	1219 aa		3.67	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
BLI1	YKL061W	NUT2	Q06213	157 aa		3.67	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	ALG3	P38179	458 aa		3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	MOH1	P38191	138 aa		3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	MDJ2	P42834	146 aa		3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	EST2	Q06163	884 aa		3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	HMI1	Q12039	706 aa		3.66	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	OAR1	P35731	278 aa		3.65	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	DAL4	Q04895	635 aa		3.65	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	TOS4	Q06266	489 aa		3.65	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	APL1	P27351	700 aa		3.64	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	PLB1	P39105	664 aa		3.64	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	LEO1	P38439	464 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	ERP5	P38819	212 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	DAK2	P43550	591 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	SVS1	Q12254	260 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	ATF1	P40353	525 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	SNM1	P40993	198 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	UBA2	P52488	636 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	SIZ1	Q04195	904 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	BDF2	Q07442	638 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	YPL260W	Q08977	551 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
BLI1	YKL061W	YPL109C	Q02981	657 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	MSC2	Q03455	724 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	ADI1	Q03677	179 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	AIM39	Q08223	395 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	YER152C	P10356	443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	PEP7	P32609	515 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	PIC2	P40035	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	EXG2	P52911	562 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
BLI1	YKL061W	TPO1	Q07824	586 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	VPS35	P34110	944 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	FAA3	P39002	694 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	MND2	P40577	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	ROD1	Q02805	837 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	ADY3	Q07732	790 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	MET12	P46151	657 aa		3.53	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	TMN2	Q04562	672 aa		3.53	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	ATG13	Q06628	738 aa		3.53	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	LAS17	Q12446	633 aa		3.53	□□□□□ -1.84
BLI1	YKL061W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	IOC3	P43596	787 aa		3.52	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	YLR040C	Q07988	224 aa		3.52	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	KCS1	Q12494	1050 aa		3.52	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	HIS5	P07172	385 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	ACE2	P21192	770 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	BAS1	P22035	811 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	MLS1	P30952	554 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	MKK2	P32491	506 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	POA1	P38218	177 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	HFM1	P51979	1187 aa		3.51	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	CHA4	P43634	648 aa		3.5	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	YOL073C	Q08232	322 aa		3.5	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	RGD1	P38339	666 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	ZRG8	P40021	1076 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	STU2	P46675	888 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	BUL1	P48524	976 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	STB4	P50104	949 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	XYL2	Q07993	356 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	HAT1	Q12341	374 aa		3.49	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	BI4	P03879	638 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	ENA1	P13587	1091 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	MET4	P32389	672 aa		3.48	□□□□□ -1.85

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