RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	YDL073W	Q07454	984 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	CBF2	P32504	956 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	VPS64	Q03944	604 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	GNT1	Q12096	491 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SEC65	P29478	273 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SWC5	P38326	303 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SYG1	P40528	902 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	ATG36	P46983	293 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	HFM1	P51979	1187 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	HEH2	Q03281	663 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	ALR1	Q08269	859 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	YIG1	Q08956	461 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	IES3	Q12345	250 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	OCA6	Q12454	224 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SEC2	P17065	759 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	UGA3	P26370	528 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	BUD7	Q08754	746 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RGT1	YKL038W	SEM1	O94742	89 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	MRPL25	P23369	157 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	GYP6	P32806	458 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	THI12	P42883	340 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	THI5	P43534	340 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	JJJ2	P46997	583 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	THI11	P47183	340 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YML020W	Q03722	664 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	VPS38	Q05919	439 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	THI13	Q07748	340 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	CLB3	P24870	427 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	STE13	P33894	931 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	EFM2	P38347	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PRY3	P47033	881 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PCL10	P53124	433 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YLR001C	Q07895	862 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	CDC8	P00572	216 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	REC107	P21651	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	NUP120	P35729	1037 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PSY4	P38193	441 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	REV7	P38927	245 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	GCD10	P41814	478 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YGR266W	P53326	701 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YKR005C	Q02203	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	ARP9	Q05123	467 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	HIM1	Q06674	414 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	AVO1	Q08236	1176 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YML108W	Q03759	105 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	APC2	Q12440	853 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	ADH4	P10127	382 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	MMT1	Q03218	510 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	OPY2	Q06810	360 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PKC1	P24583	1151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SEC8	P32855	1065 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	MAL33	P38157	468 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	GYP7	P48365	746 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YGR122W	P53272	402 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PEP7	P32609	515 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	HSP78	P33416	811 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SRL3	P36167	246 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	BRL1	P38770	471 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	TFB3	Q03290	321 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	COA4	Q05809	96 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	VAC14	Q06708	880 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	HIS3	P06633	220 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	MST1	P07236	462 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	SEC15	P22224	910 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RGT1	YKL038W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49

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