RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	MON1	P53129	644 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	YNR063W	P53749	607 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	KAR5	Q04746	504 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	SPO21	Q12411	609 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	MSH3	P25336	1018 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	EMC1	P25574	760 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
YJL135W	YJL135W	SNF5	P18480	905 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	MDJ2	P42834	146 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	NDJ1	Q12366	352 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	KIP1	P28742	1111 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	SAM37	P50110	327 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
YJL135W	YJL135W	SIZ1	Q04195	904 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
YJL135W	YJL135W	VPS35	P34110	944 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	ERP5	P38819	212 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	PLB1	P39105	664 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	TMN2	Q04562	672 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	ADD66	P36040	267 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	YER158C	P40095	573 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	YCS4	Q06156	1176 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	NUT2	Q06213	157 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	PPX1	P38698	397 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	PEX13	P80667	386 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	GPI13	Q07830	1017 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	IRC10	Q08118	586 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	MCH5	Q08777	521 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	AFT2	Q08957	416 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	TAF13	P11747	167 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	GPB2	P39717	880 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	GCV2	P49095	1034 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	TAF7	Q05021	590 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	FRT1	Q99332	602 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	APL1	P27351	700 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	EXG2	P52911	562 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	HAT1	Q12341	374 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	ICT1	Q12385	394 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	RDH54	P38086	958 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	RSM26	P47141	266 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	ENT3	P47160	408 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	OMS1	Q06668	471 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	YAP7	Q08182	245 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	YPL260W	Q08977	551 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	SVS1	Q12254	260 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	PTC5	Q12511	572 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YJL135W	YJL135W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SEC20	P28791	383 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	TIM44	Q01852	431 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MSC2	Q03455	724 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	HOF1	Q05080	669 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YOL073C	Q08232	322 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	AFG2	P32794	780 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YHL050C	P38721	697 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YHR219W	P38900	624 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MET12	P46151	657 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.89	□□□□□ -1.95	not detected
YJL135W	YJL135W	HIS5	P07172	385 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MET4	P32389	672 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SQT1	P35184	431 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YPL109C	Q02981	657 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ADI1	Q03677	179 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	EST2	Q06163	884 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ATG13	Q06628	738 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ACF2	Q12168	779 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ALG3	P38179	458 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	PEX28	P38848	579 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MND2	P40577	368 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	STB4	P50104	949 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ULP1	Q02724	621 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ADY3	Q07732	790 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	TPO1	Q07824	586 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	ENB1	Q08299	606 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	OXR1	Q08952	273 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	PEP7	P32609	515 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	TMT1	P32643	299 aa		2.86	□□□□□ -1.95

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