RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 BARGINQ6ZT62 677 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 USP35Q9P2H5 1018 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 NUDCQ9Y266 331 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 PEAK1Q9H792 1746 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 RIMBP2O15034 1052 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 PPP2R1AP30153 589 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 MMRN1Q13201 1228 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 GLI3P10071 1580 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 IL2RBP14784 551 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-210ENST00000547912 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 FAM205CA6NFA0 338 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 EXOC5O00471 708 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 NEFMP07197 916 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PDE3BQ13370 1112 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 DDB1Q16531 1140 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 RGS12O14924 1447 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 IL13P35225 146 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 MICALL2Q8IY33 904 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 NBPF4Q96M43 638 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 EYA1Q99502 592 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 SPG7Q9UQ90 795 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 TNS2Q63HR2 1409 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 DISP2A7MBM2 1401 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 NCAPD2Q15021 1401 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 LRRC37A3O60309 1634 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 KDRP35968 1356 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 FCHSD2O94868 740 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 MEGF6O75095 1541 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-210ENST00000547912 POTEB3A0JP26 581 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 HMOX1P09601 288 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 POTEBQ6S5H4 581 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 CCDC125Q86Z20 511 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 MRS2Q9HD23 443 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 ILDR2Q71H61 639 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 BCL9O00512 1426 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 PRKAR2BP31323 418 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 CCER2I3L3R5 266 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 PHKG2P15735 406 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-210ENST00000547912 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.4 ms