RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 STRN4Q9NRL3 753 aa25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.67■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 MYT1Q01538 1121 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 BTG4Q9NY30 223 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 PHKG2P15735 406 aa25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 EVA1CP58658 441 aa25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 SPG7Q9UQ90 795 aa25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP27B1O15528 508 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 TEFQ10587 303 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNQ3O43525 872 aa25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 CERKQ8TCT0 537 aa25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS2O95450 1211 aa25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 BTBD11A6QL63 1104 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC4O15439 1325 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 IL2RBP14784 551 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 NRAPQ86VF7 1730 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 USP35Q9P2H5 1018 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNA1FO60840 1977 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 SMC5Q8IY18 1101 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 MRC1P22897 1456 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF5Q96JK2 942 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS12O14924 1447 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC4A2P04920 1241 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 G2E3Q7L622 706 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 NECTIN2Q92692 538 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 DISP2A7MBM2 1401 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A6Q13433 755 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRCP08575 1304 aa25.45■■□□□ 1.67
PACSIN3-211ENST00000539589 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 JCADQ9P266 1359 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 SLIT2O94813 1529 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXB7P09629 217 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF790Q6PG37 636 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 STK31Q9BXU1 1019 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 NUCB1Q02818 461 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 C5P01031 1676 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 GCC1Q96CN9 775 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 CABP4P57796 275 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-211ENST00000539589 FLIIQ13045 1269 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 GLI3P10071 1580 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 LRP6O75581 1613 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 F6X3S4 739 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC24BO95487 1268 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPPAQ13219 1627 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGB4P16144 1822 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA1LP34931 641 aa25.35■■□□□ 1.65
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