RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNRH1P01148 92 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLN3Q13286 438 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTK7Q13308 1070 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC102BQ68D86 513 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF217Q8TC41 542 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNKSR1Q969H4 720 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIRT1Q96EB6 747 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM47Q96LD4 638 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF358Q9NW07 568 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP3Q9Y6I4 520 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 CARNS1A5YM72 827 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L15C9J2P7 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L10C9JJH3 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L12C9JPN9 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L11C9JVI0 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L21D6R901 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L18D6R9N7 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L22D6RA61 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L19D6RCP7 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L20D6RJB6 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 INHAP05111 366 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 RHOQP17081 205 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 CENPCQ03188 943 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP17L24Q0WX57 530 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBCELQ5QJ74 424 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 XAGE2Q96GT9 111 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARXQ96QS3 562 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPYDQ12882 1025 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM50Q86XT4 487 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNS4Q8IZW8 715 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 STK32AQ8WU08 396 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 NLRP3Q96P20 1036 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM196BA6NMK8 535 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAN1A2O60476 641 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHKA2P46019 1235 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 VEGFBP49765 207 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP1A2P50993 1020 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 POU4F2Q12837 409 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TLR1Q15399 786 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIX5Q8N196 739 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 LARGE2Q8N3Y3 721 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SENP2Q9HC62 589 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMTNP53814 917 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 EPHA4P54764 986 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ESCO1Q5FWF5 840 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC4A9Q96Q91 983 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLAIN2Q9P270 581 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 PARP3Q9Y6F1 533 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 A6NJY4 79 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATG7O95352 703 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEC13P55735 322 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTSQ03393 145 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 C4orf17Q53FE4 359 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM52Q96A61 297 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIFC2Q96AC6 838 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 HINFPQ9BQA5 517 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 C21orf2O43822 256 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPC1P35052 558 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCNN1AP37088 669 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTFR1Q15390 333 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF15Q8N660 670 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLRG1Q96E93 195 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 BACH1O14867 736 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.6 ms