RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 RNF181Q9P0P0 153 aa14.95□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.95□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 ITPK1Q13572 414 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 PIM2Q9P1W9 311 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 WDR90Q96KV7 1748 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 RFC4P35249 363 aa14.93□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 INSRP06213 1382 aa14.91□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 FYB1O15117 783 aa14.91□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.91□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 SLC24A1O60721 1099 aa14.9□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.9□□□□□ -0.02
COPB2-208ENST00000512153 FLT4P35916 1363 aa14.89□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 ADRA2BP18089 450 aa14.89□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 ATG3Q9NT62 314 aa14.89□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 GYS1P13807 737 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 KCNA3P22001 575 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 DCAF5Q96JK2 942 aa14.87□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.86□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 RPS6KA4O75676 772 aa14.86□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 ITGB4P16144 1822 aa14.85□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 PHKG2P15735 406 aa14.85□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.036e-10■■■■□ 19.5
COPB2-208ENST00000512153 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.85□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 CHRNA5P30532 468 aa14.84□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 PCNTO95613 3336 aa14.84□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.84□□□□□ -0.03
COPB2-208ENST00000512153 TESK2Q96S53 571 aa14.83□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 GLTPD2A6NH11 291 aa14.82□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 EYA1Q99502 592 aa14.82□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.81□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 LMNB1P20700 586 aa14.81□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 RASSF7Q02833 373 aa14.81□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.81□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.81□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 CABP4P57796 275 aa14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 FKBP8Q14318 412 aa14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 C4AP0C0L4 1744 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 TONSLQ96HA7 1378 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 ZPR1O75312 459 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 DDR1Q08345 913 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB2-208ENST00000512153 AIDAQ96BJ3 306 aa14.77□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 KDRP35968 1356 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 CDCA8Q53HL2 280 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 TTLL6Q8N841 843 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 MTHFSP49914 203 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 CREBZFQ9NS37 354 aa14.74□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 FOXN1O15353 648 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 SLC34A2O95436 690 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 TM4SF1P30408 202 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 H0YIN7 160 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 CHADLQ6NUI6 762 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.72□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 ERFEQ4G0M1 354 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 POLKQ9UBT6 870 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 NCAPD2Q15021 1401 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB2-208ENST00000512153 SBF1O95248 1867 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms