RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP17L8P0C7I0 530 aa8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MORC1Q86VD1 984 aa8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HLA-CQ95604 372 aa8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.45□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RLBP1P12271 317 aa8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GUCA2AQ02747 115 aa8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP19O94966 1318 aa8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GJA5P36382 358 aa8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.44□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STAC3Q96MF2 364 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HOXA2O43364 376 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTHFSP49914 203 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MLECQ14165 292 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOS1P29475 1434 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPATQ14207 1427 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GCGRP47871 477 aa8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC10A3P09131 477 aa8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GLMNQ92990 594 aa8.42□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FDX1P10109 184 aa8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSEN2P49810 448 aa8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDE3AQ14432 1141 aa8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RUNDC1Q96C34 613 aa8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPRMP28827 1452 aa8.41□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.4□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RETREG2Q8NC44 543 aa8.4□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.4□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.4□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.4□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MROH2AA6NES4 1674 aa8.39□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSC1Q92574 1164 aa8.39□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.39□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOCS7O14512 581 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYOM2P54296 1465 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIF1BO60333 1816 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP46P62068 366 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIK3C2BO00750 1634 aa8.38□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IRF5Q13568 498 aa8.37□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STK26Q9P289 416 aa8.37□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.37□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.37□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.37□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SHPRHQ149N8 1683 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTMR2Q13614 643 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR63Q8IWG1 891 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POGKQ9P215 609 aa8.36□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR37L1O60883 481 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FUT2Q10981 343 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NGEFQ8N5V2 710 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZMYM3Q14202 1370 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFAP99D6REC4 459 aa8.35□□□□□ -1.07
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNPHO15079 494 aa8.35□□□□□ -1.07
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