RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP7BP35670 1465 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 MPNDQ8N594 471 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 NEUROD2Q15784 382 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 RGL3Q3MIN7 710 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC15P60006 121 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF214Q8ND24 703 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 PXDNQ92626 1479 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF3Q5VWG9 929 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF2CQ99661 725 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 SYCE3A1L190 88 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF3AQ9Y496 699 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 SBNO1A3KN83 1393 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 24.6
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.27□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.27□□□□□ -0.76
RABGEF1-203ENST00000439720 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 PKP1Q13835 747 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 GPT2Q8TD30 523 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 JCADQ9P266 1359 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ4P48050 445 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 LNPKQ9C0E8 428 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF16BQ96L93 1317 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 GPATCH11Q8N954 259 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 NUCB2P80303 420 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 NRAPQ86VF7 1730 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-203ENST00000439720 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SLIT3O75094 1523 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF3P18847 181 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 SLAIN2Q9P270 581 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM193AP78312 1265 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPY26PQ9H489 355 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF10O15013 1369 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 BRD1O95696 1058 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD7Q92527 254 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 OGFRQ9NZT2 677 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-203ENST00000439720 USP25Q9UHP3 1055 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.3 ms