RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC87Q9NVE4 849 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF14O94880 888 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAPNS2Q96L46 248 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C4AP0C0L4 1744 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP2K2P36507 400 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLRP6P59044 892 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.07□□□□□ -0.32
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGL3Q3MIN7 710 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADGRB1O14514 1584 aa13.02□□□□□ -0.33
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNH5Q8NCM2 988 aa13□□□□□ -0.33
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMF1P82094 1093 aa12.98□□□□□ -0.33
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRNA5P30532 468 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPM7Q96QT4 1865 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERFEQ4G0M1 354 aa12.93□□□□□ -0.34
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.92□□□□□ -0.34
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.9□□□□□ -0.34
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOX12O15370 315 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GYS1P13807 737 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa12.89□□□□□ -0.35
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UNC80Q8N2C7 3258 aa12.86□□□□□ -0.35
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CST9Q5W186 159 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HACL1Q9UJ83 578 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LTN1O94822 1766 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INSRP06213 1382 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGB4P16144 1822 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPHX2P34913 555 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OTUD5Q96G74 571 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP290O15078 2479 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADRA2BP18089 450 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTLL6Q8N841 843 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL9A1P20849 921 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLA2G5P39877 138 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIK1P57059 783 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APLP2Q06481 763 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDR1Q08345 913 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOGQ13253 232 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITPK1Q13572 414 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CABP2Q9NPB3 220 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
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