RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PRU2 124 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 DOC2BQ14184 412 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 GATA4P43694 442 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 NR6A1Q15406 480 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF11Q86T75 865 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 BMP4P12644 408 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 ITGB7P26010 798 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 CHRNA4P43681 627 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 ARTNQ5T4W7 220 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 PGBD3Q8N328 593 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 BTBD6Q96KE9 485 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 CLN3Q13286 438 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 RFC5P40937 340 aa6.4□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.4□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 GGA1Q9UJY5 639 aa6.4□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1B0GTH6 734 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 EPXP11678 715 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 ARAFP10398 606 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 DGKGP49619 791 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 EFHC2Q5JST6 749 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 RNF20Q5VTR2 975 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 AP1G2O75843 785 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 ERVK-9P63128 1117 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 FGFR3P22607 806 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 RNF135Q8IUD6 432 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 GPAMQ9HCL2 828 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF592Q92610 1267 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 GNASQ5JWF2 1037 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 APBA3O96018 575 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L8P0C7I0 530 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-202ENST00000423339 THBS1P07996 1170 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 CHSY3Q70JA7 882 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 C2CD2LO14523 706 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 DYRK3O43781 588 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 GNRH1P01148 92 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ADH6P28332 368 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 NACC1Q96RE7 527 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 SNRKQ9NRH2 765 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 MSX1P28360 303 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 PHKA2P46019 1235 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 CTBSQ01459 385 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 LRP8Q14114 963 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 PLVAPQ9BX97 442 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 RUBCNLQ9H714 662 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 CENPCQ03188 943 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 BANK1Q8NDB2 785 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ZBBXA8MT70 800 aa6.29□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 BNIP3LO60238 219 aa6.29□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 CNKSR1Q969H4 720 aa6.29□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.29□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 TRAK2O60296 914 aa6.28□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 C14orf37Q86TY3 774 aa6.28□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms