RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BACH2Q9BYV9 841 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C21orf2O43822 256 aa5.74□□□□□ -1.49
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.74□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.74□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H3BRB1 525 aa5.73□□□□□ -1.49
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAPK1P28482 360 aa5.72□□□□□ -1.49
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM50Q86XT4 487 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP10Q9P2G4 905 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEPT3Q9UH03 358 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABL1P00519 1130 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EML3Q32P44 896 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q3C1V9 767 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BRICD5Q6PL45 260 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DPH6Q7L8W6 267 aa5.71□□□□□ -1.5
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.71□□□□□ -1.5
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEC13P55735 322 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPRNQ16849 979 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THAP11Q96EK4 314 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TINF2Q9BSI4 451 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOD1Q9Y239 953 aa5.7□□□□□ -1.5
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LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DSC3Q14574 896 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF592Q92610 1267 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SFI1A8K8P3 1242 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TREHO43280 583 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTK2Q05397 1052 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTMR3Q13615 1198 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL26A1Q96A83 441 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPSB2Q99619 263 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 JUNDP17535 347 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GTF2IP78347 998 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC102BQ68D86 513 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMC7Q7Z402 723 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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