RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IL2RAP01589 272 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MX2P20592 715 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RASSF7Q02833 373 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IRF5Q13568 498 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WDR44Q5JSH3 913 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 XAGE2Q96GT9 111 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MBIPQ9NS73 344 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IGF1RP08069 1367 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A0A1B0GTH6 734 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KCNMA1Q12791 1236 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GAS6Q14393 721 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TLR1Q15399 786 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EFHC2Q5JST6 749 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RUBCNLQ9H714 662 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PSME1Q06323 249 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MAP7D1Q3KQU3 841 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C4orf17Q53FE4 359 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PODNQ7Z5L7 613 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PHF24Q9UPV7 400 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARHGEF15O94989 841 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BCRP11274 1271 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SKIP12755 728 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MSX1P28360 303 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SOX11P35716 441 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PLA2G4AP47712 749 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GDF10P55107 478 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 INHAP05111 366 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BMP4P12644 408 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MCM6Q14566 821 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RRAGCQ9HB90 399 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GJA3Q9Y6H8 435 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AMPD1P23109 780 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MAP2K3P46734 347 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SMTNP53814 917 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EML3Q32P44 896 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KANK3Q6NY19 840 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BICDL1Q6ZP65 573 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CABP1Q9NZU7 370 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NOD1Q9Y239 953 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 COG6Q9Y2V7 657 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PIK3CDO00329 1044 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ACDQ96AP0 544 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BACH1O14867 736 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TATP17735 454 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SCNN1DP51172 638 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FLIIQ13045 1269 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NBPF1Q3BBV0 1214 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KLRG1Q96E93 195 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 POM121Q96HA1 1249 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PARP3Q9Y6F1 533 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A6NJY4 79 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CDK2AP1O14519 115 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FGFR3P22607 806 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GTF2IP78347 998 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CTBSQ01459 385 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A0A1W2PNR3 127 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OIP5O43482 229 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BNIP3LO60238 219 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GSK3AP49840 483 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NCOA4Q13772 614 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms