RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.92■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 CRBNQ96SW2 442 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.9■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.89■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 MRC1P22897 1456 aa25.88■■□□□ 1.73
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ODC1-202ENST00000405333 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ODC1-202ENST00000405333 SLC39A6Q13433 755 aa25.88■■□□□ 1.73
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ODC1-202ENST00000405333 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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ODC1-202ENST00000405333 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.87■■□□□ 1.73
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ODC1-202ENST00000405333 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.86■■□□□ 1.73
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ODC1-202ENST00000405333 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-202ENST00000405333 NECTIN2Q92692 538 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-202ENST00000405333 EXOC5O00471 708 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-202ENST00000405333 CABP4P57796 275 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-202ENST00000405333 TRIM27P14373 513 aa25.83■■□□□ 1.73
ODC1-202ENST00000405333 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.83■■□□□ 1.73
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF790Q6PG37 636 aa25.81■■□□□ 1.72
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ODC1-202ENST00000405333 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-202ENST00000405333 KIF16BQ96L93 1317 aa25.81■■□□□ 1.72
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ODC1-202ENST00000405333 COG6Q9Y2V7 657 aa25.8■■□□□ 1.72
ODC1-202ENST00000405333 DDB1Q16531 1140 aa25.8■■□□□ 1.72
ODC1-202ENST00000405333 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.8■■□□□ 1.72
ODC1-202ENST00000405333 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.8■■□□□ 1.72
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ODC1-202ENST00000405333 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-202ENST00000405333 SLC4A2P04920 1241 aa25.77■■□□□ 1.72
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ODC1-202ENST00000405333 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.71■■□□□ 1.71
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ODC1-202ENST00000405333 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.71■■□□□ 1.71
ODC1-202ENST00000405333 A0A0G2JS52 829 aa25.71■■□□□ 1.71
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ODC1-202ENST00000405333 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.7■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 ATRNO75882 1429 aa25.69■■□□□ 1.7
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ODC1-202ENST00000405333 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.68■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.68■■□□□ 1.7
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ODC1-202ENST00000405333 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.67■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.67■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.67■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 BCL9O00512 1426 aa25.66■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 ABCC4O15439 1325 aa25.66■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 PROSER3Q2NL68 480 aa25.66■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 MS4A1P11836 297 aa25.65■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 USP16Q9Y5T5 823 aa25.65■■□□□ 1.7
ODC1-202ENST00000405333 F6X3S4 739 aa25.65■■□□□ 1.7
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