RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.22■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.22■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 AIDAQ96BJ3 306 aa28.22■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 IDH1O75874 414 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PAF1Q8N7H5 531 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIN2BQ13224 1484 aa28.2■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF5CO60282 957 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 URI1O94763 535 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 SPA17Q15506 151 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 HECW1Q76N89 1606 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 SHTN1A0MZ66 631 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP1P11387 765 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 USP25Q9UHP3 1055 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM10Q7L590 875 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 EZRP15311 586 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP9Q49MG5 647 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNJ1O43426 1573 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 TNNT1P13805 278 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL10Q6JEL2 608 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAGE5O15320 804 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF76P36508 570 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTAB-201ENST00000299314 INCENPQ9NQS7 918 aa28.14■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 C8orf76Q96K31 380 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC11Q96J66 1382 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.12■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM3P25205 808 aa28.12■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 USP5P45974 858 aa28.12■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCY1B3Q02153 619 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL24Q5JXM2 366 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 NEMFO60524 1076 aa28.09■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 SSR1P43307 286 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-201ENST00000299314 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 DYDC1Q8WWB3 177 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 TSG101Q99816 390 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ADCY5O95622 1261 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 TMX1Q9H3N1 280 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCF2Q9UG63 623 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GIMAP7Q8NHV1 300 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM5P33992 734 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GSDMDP57764 484 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 FSIP1Q8NA03 581 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GDPD2Q9HCC8 539 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GJB2P29033 226 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 NAIPQ13075 1403 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 MYD88Q99836 296 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 DESP17661 470 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CNNM3Q8NE01 707 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 STX1AQ16623 288 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 LUZP1Q86V48 1076 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 F6X3S4 739 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.3 ms