RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116376.8

Sh3bp5l-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp5l, Length 3,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dnajc5gQ8C632 165 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Q9D2X8 372 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Disp3A3KFU9 1347 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Q3TQI7 289 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccne1Q61457 408 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Srgap3Q812A2 1099 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmx3Q8BXZ1 456 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm10563F6WIE4 79 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Snap23O09044 210 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 ImpactO55091 318 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nid2O88322 1403 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zkscan16A2ALW2 728 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Anapc15P60007 132 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Taok2Q6ZQ29 1240 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gtf2a1Q99PM3 378 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Bcar3Q9QZK2 820 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cnksr1A2A9K7 700 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 RestQ8VIG1 1082 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mcmdc2E9Q956 681 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nfat5Q9WV30 1534 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abcc12Q80WJ6 1366 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kdm6aO70546 1401 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 C3P01027 1663 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Vwa3bJ9JI28 736 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atg3Q9CPX6 314 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rasa1E9PYG6 1038 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Amotl1Q9D4H4 968 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 CoilQ5SU73 570 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sox12Q04890 314 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ncoa4Q5U4H9 625 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zdhhc9P59268 364 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Chpf2Q3UU43 768 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 MccE9PWI3 1003 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Col14a1Q80X19 1797 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp6v1dP57746 247 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 NexnQ7TPW1 607 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gli3Q61602 1583 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cwc27Q3TKY6 469 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmem2Q5FWI3 1383 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Siglec1Q62230 1695 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hmox1P14901 289 aa15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cyp2d11P24457 504 aa15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccdc7Q9D541 371 aa15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm45015A0A140LII9 184 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm18336A0A140LIU8 765 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ier5O89113 308 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cct4P80315 539 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Prune1Q8BIW1 454 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gimap6Q8K349 305 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmem94Q7TSH8 1360 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Brpf1B2RRD7 1212 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Echdc1Q9D9V3 322 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmem132eQ6IEE6 982 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Slc35g1Q8BY79 368 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 SlkO54988 1233 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Trim44Q9QXA7 346 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ms4a2P20490 235 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Strn4P58404 760 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Filip1lQ6P6L0 1131 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Col1a2Q01149 1372 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Bend3Q6PAL0 825 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 KinQ8K339 391 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kcnh5Q920E3 988 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gdpd2Q9ESM6 539 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp10bB1AWN4 1474 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mum1Q6DID5 682 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Unc5clQ6R653 518 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fyb1O35601 819 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 St18Q80TY4 1045 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Aox2Q5SGK3 1345 aa15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tns3Q5SSZ5 1440 aa15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rad50P70388 1312 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.5 ms