RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088512.11

Rnps1-201, Transcript of RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnps1, Length 1,798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Echdc1Q9D9V3 322 aa16.12■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa16.11■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pnpla7A2AJ88 1352 aa16.11■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Triml2E9PW10 424 aa16.1■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fam83gQ5SWY7 812 aa16.1■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fam13aQ8BGI4 693 aa16.1■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Amigo3Q8C2S7 508 aa16.1■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zranb3Q6NZP1 1069 aa16.1■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Abca15E9PWH4 1668 aa16.09■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Phkg2Q9DB30 406 aa16.09■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Disp3A3KFU9 1347 aa16.08■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Wdr63B2RY71 923 aa16.08■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pdzd9Q9D9M4 266 aa16.08■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Taf7Q9R1C0 341 aa16.08■□□□□ 0.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Dlg5E9Q9R9 1921 aa16.08■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rabep1O35551 862 aa16.08■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa16.08■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Slx1bQ8BX32 270 aa16.08■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ssfa2Q922B9 1252 aa16.08■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 BcorQ8CGN4 1759 aa16.07■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 FocadA2AKG8 1798 aa16.06■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zpr1Q62384 459 aa16.06■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa16.06■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 GckrQ91X44 587 aa16.06■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Tns2Q8CGB6 1400 aa16.06■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mre11Q61216 706 aa16.05■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cog6Q8R3I3 657 aa16.05■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Tnnt1O88346 262 aa16.05■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Aplp1Q03157 653 aa16.05■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa16.04■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 ChgaP26339 463 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Atp8b2P98199 1209 aa16.04■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Tnks1bp1P58871 1720 aa16.03■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 RgmbQ7TQ33 436 aa16.03■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 TefQ9JLC6 301 aa16.03■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Nphp1Q9QY53 687 aa16.03■□□□□ 0.16
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fkbp4P30416 458 aa16.02■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 CenppQ9CZ92 286 aa16.02■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa16.02■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Iqsec3Q3TES0 1195 aa16.01■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Srgap3Q812A2 1099 aa16.01■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 HellsQ60848 821 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mum1Q6DID5 682 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 FanclQ9CR14 375 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zeb2Q9R0G7 1215 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pnmal2G3X9N3 661 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cers3Q1A3B0 383 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa16■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Sptbn5F6UCX4 1208 aa15.99■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mmp8O70138 465 aa15.99■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Bend3Q6PAL0 825 aa15.99■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 SympkQ80X82 1284 aa15.99■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ccdc146E9Q9F7 977 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Irf9Q61179 399 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Irx6Q9ER75 438 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fam50bQ9WTJ8 334 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mcmdc2E9Q956 681 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Asic4Q7TNS7 539 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Slc5a1Q8C3K6 665 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Tceal9Q9DD24 104 aa15.98■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Flt4P35917 1363 aa15.97■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ccdc155Q80VJ8 648 aa15.97■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zkscan2G3X952 960 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cyp2d11P24457 504 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Atg4aQ8C9S8 396 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Flad1Q8R123 492 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Speer4bQ9D9F7 267 aa15.96■□□□□ 0.15
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Nkx2-3P97334 362 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cwc27Q3TKY6 469 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Txnrd1Q9JMH6 613 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Nek4Q9Z1J2 792 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm7361D3Z6R1 267 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm1979E9QAN3 267 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm5862K7N5V5 267 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm10220K7N660 267 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Map3k2Q61083 619 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pard3Q99NH2 1333 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Adcy9P51830 1353 aa15.95■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cyb5rlB1AS42 316 aa15.94■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm10093D3YYI8 482 aa15.94■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ier5O89113 308 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms