RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028948.4

Gins1-201, Transcript of DNA replication complex GINS protein PSF1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gins1, Length 1,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins1-201ENSMUST00000028948 Nkx2-3P97334 362 aa20.48■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa20.47■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Pde4dQ01063 747 aa20.47■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Kndc1Q0KK55 1742 aa20.47■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Sgip1Q8VD37 806 aa20.46■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Efcab2Q9CQ46 164 aa20.46■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cabp2Q9JLK4 216 aa20.46■□□□□ 0.87
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa20.45■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Snap23O09044 210 aa20.45■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Kcnn1Q9EQR3 537 aa20.45■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Zfyve9A2A8R0 1397 aa20.45■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Abcc12Q80WJ6 1366 aa20.45■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Lrrc43Q3V0L5 667 aa20.43■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Nav1Q8CH77 1875 aa20.43■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Adcy9P51830 1353 aa20.41■□□□□ 0.86
Gins1-201ENSMUST00000028948 Amhr2Q8K592 568 aa20.39■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 CpzQ8R4V4 654 aa20.39■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gpr162Q3UN16 588 aa20.37■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tlr8P58682 1032 aa20.36■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa20.36■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa20.35■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tgfb2P27090 414 aa20.35■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Btbd11Q6GQW0 1109 aa20.35■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Syde2E9PUP1 1314 aa20.34■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 1810065E05RikQ5NC41 235 aa20.34■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Q4VA45 678 aa20.33■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Clcn1Q64347 994 aa20.33■□□□□ 0.85
Gins1-201ENSMUST00000028948 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Atp1b3P97370 278 aa20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Yy1Q00899 414 aa20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Zbtb1Q91VL9 713 aa20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 PigbQ9JJQ0 542 aa20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Myo5bP21271 1818 aa20.32■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cyp2c67Q569X9 491 aa20.31■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Slfnl1Q8BHW9 410 aa20.31■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Mylk2Q8VCR8 613 aa20.31■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 SnrkQ8VDU5 748 aa20.31■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 MetP16056 1379 aa20.31■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cfap70D3YVL2 1141 aa20.3■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Wdhd1P59328 1117 aa20.3■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Q7TT23 1179 aa20.3■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Camkk2Q8C078 588 aa20.3■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Taf1dQ9D4V4 322 aa20.29■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cyp2c69E9PXC3 491 aa20.28■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Wdr66E9Q743 1299 aa20.28■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cyp2c40P56657 491 aa20.28■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Irx6Q9ER75 438 aa20.28■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Apaf1O88879 1249 aa20.27■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa20.27■□□□□ 0.84
Gins1-201ENSMUST00000028948 StrcQ8VIM6 1809 aa20.26■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cers3Q1A3B0 383 aa20.26■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cnnm1Q0GA42 951 aa20.25■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gm12185Q5NCB2 835 aa20.25■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Flad1Q8R123 492 aa20.25■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa20.25■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 TefQ9JLC6 301 aa20.25■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Casz1Q9CWL2 1761 aa20.24■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 ArsiQ32KI9 573 aa20.24■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Trip6Q9Z1Y4 480 aa20.24■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Usp19Q3UJD6 1360 aa20.23■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 FktnQ8R507 461 aa20.23■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ubn2Q80WC1 1314 aa20.23■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Strn4P58404 760 aa20.22■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tktl2Q9D4D4 627 aa20.22■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Prim1P20664 417 aa20.21■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ggnbp2Q5SV77 696 aa20.21■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 TrhQ62361 256 aa20.21■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Dpf1Q9QX66 387 aa20.21■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Atf7ipQ7TT18 1306 aa20.21■□□□□ 0.83
Gins1-201ENSMUST00000028948 Prr29B1ARI9 187 aa20.2■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Prr5lA2AVJ5 370 aa20.19■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Iqsec3Q3TES0 1195 aa20.19■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 IarsQ8BU30 1262 aa20.19■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Slc34a2Q9DBP0 697 aa20.19■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Znf541Q0GGX2 1363 aa20.19■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Prdm11A2AGX3 565 aa20.18■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cavin4A2AMM0 362 aa20.18■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Spon1Q8VCC9 807 aa20.18■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Slurp2P0DP59 97 aa20.17■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Col1a2Q01149 1372 aa20.17■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ddx60E9PZQ1 1711 aa20.16■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa20.16■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Lama4P97927 1816 aa20.16■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Prkab2Q6PAM0 271 aa20.16■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Golga2Q921M4 999 aa20.16■□□□□ 0.82
Gins1-201ENSMUST00000028948 Adgre1Q61549 931 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.5 ms