RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Siglec1Q62230 1695 aa11.67□□□□□ -0.54
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gcc1Q9D4H2 778 aa11.67□□□□□ -0.54
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Triml2E9PW10 424 aa11.66□□□□□ -0.54
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Phkg2Q9DB30 406 aa11.66□□□□□ -0.54
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Scn4aQ9ER60 1841 aa11.66□□□□□ -0.54
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bcl9lQ67FY2 1494 aa11.66□□□□□ -0.54
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnai1Q8C0M8 701 aa11.64□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyb5rlB1AS42 316 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Aplp1Q03157 653 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slx1bQ8BX32 270 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Stk36Q69ZM6 1316 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slit1Q80TR4 1531 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gli3Q61602 1583 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ArsiQ32KI9 573 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 RgmbQ7TQ33 436 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GckrQ91X44 587 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ssfa2Q922B9 1252 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Akt1s1Q9D1F4 257 aa11.63□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Irx6Q9ER75 438 aa11.63□□□□□ -0.55
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pnpla7A2AJ88 1352 aa11.62□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fkbp4P30416 458 aa11.62□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Wdr63B2RY71 923 aa11.61□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa11.61□□□□□ -0.55
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zeb2Q9R0G7 1215 aa11.6□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nkx1-2P42580 305 aa11.6□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp8b2P98199 1209 aa11.6□□□□□ -0.55
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc155Q80VJ8 648 aa11.6□□□□□ -0.55
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Srgap3Q812A2 1099 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gimap5Q8BWF2 308 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc5a1Q8C3K6 665 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Speer4bQ9D9F7 267 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc34a2Q9DBP0 697 aa11.58□□□□□ -0.56
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tns2Q8CGB6 1400 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Asic4Q7TNS7 539 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SympkQ80X82 1284 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa11.58□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Styxl1Q9DAR2 321 aa11.58□□□□□ -0.56
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm7361D3Z6R1 267 aa11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc146E9Q9F7 977 aa11.57□□□□□ -0.56
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10220K7N660 267 aa11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Irf9Q61179 399 aa11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mum1Q6DID5 682 aa11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 FanclQ9CR14 375 aa11.57□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa11.57□□□□□ -0.56
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nkx2-3P97334 362 aa11.56□□□□□ -0.56
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa11.56□□□□□ -0.56
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