RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mx2Q9WVP9 655 aa23.89■■□□□ 1.42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Map3k19E9Q3S4 1311 aa23.89■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Serpina10Q8R121 448 aa23.88■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam184aE9PW83 1143 aa23.88■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Casc1Q6TDU8 730 aa23.88■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca14E9Q8F8 1683 aa23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MccE9PWI3 1003 aa23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hmox1P14901 289 aa23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnajc14Q921R4 703 aa23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa23.87■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Naa30Q8CES0 364 aa23.86■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pibf1E9Q6K3 756 aa23.86■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa23.86■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anapc15P60007 132 aa23.85■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sytl4Q9R0Q1 673 aa23.84■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp51Q3U4L8 781 aa23.84■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp2b3Q0VF55 1220 aa23.83■■□□□ 1.41
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcmtd1P59913 357 aa23.83■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp251Q6PCX8 632 aa23.83■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa23.82■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa23.82■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Jakmip1Q8BVL9 626 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 KinQ8K339 391 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Qser1A2BIE1 1698 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf316Q6PGE4 1016 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Idi2Q8BFZ6 227 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Samm50Q8BGH2 469 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stk31Q99MW1 1018 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc7Q9D541 371 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nphp1Q9QY53 687 aa23.81■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Srgap3Q812A2 1099 aa23.8■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 EzrP26040 586 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Irx4Q9QY61 515 aa23.79■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lmod3E9QA62 571 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Strn4P58404 760 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr93Q402B2 695 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plekhg1F6S200 1446 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NpatQ8BMA5 1420 aa23.77■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MpripP97434 1024 aa23.77■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam43aQ8BUP8 424 aa23.77■■□□□ 1.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mmel1Q9JLI3 765 aa23.76■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ggnbp2Q5SV77 696 aa23.76■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kcnf1Q7TSH7 493 aa23.76■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zscan22Q8BGS5 496 aa23.76■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa23.75■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sv2bQ8BG39 683 aa23.75■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ube2hP62257 183 aa23.75■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cfap73J3QPZ5 306 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mmp8O70138 465 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ms4a2P20490 235 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpatch11Q3UFS4 262 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nxf2Q4ZGD8 691 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Med4Q9CQA5 270 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif4a2P10630 407 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DpydQ8CHR6 1025 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 EappQ5BU09 281 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc178Q8CDV0 866 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nucb2P81117 420 aa23.72■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bach1P97302 739 aa23.72■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Oxsr1Q6P9R2 527 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sass6Q80UK7 654 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stx6Q9JKK1 255 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pof1bQ8K4L4 587 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccne1Q61457 408 aa23.7■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prim1P20664 417 aa23.7■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim30aP15533 496 aa23.69■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 U2af2P26369 475 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam83gQ5SWY7 812 aa23.69■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mlh1Q9JK91 760 aa23.69■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa23.69■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp8b2P98199 1209 aa23.68■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cwc27Q3TKY6 469 aa23.68■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Babam1Q3UI43 333 aa23.68■■□□□ 1.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Snx13Q6PHS6 957 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms