Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC61Q9Y6R9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC61Q9Y6R9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms