Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD54BQ9Y620 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms