Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFG3L2Q9Y4W6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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